У нас новая версия сайта. Сейчас сайт работает в тестовом режиме, ведутся технические работы.
На прежнюю версию сайта вы можете перейти по ссылке - old.kantiana.ru. Ваши правки и предложения мы рады будем получить через Интернет-приемную Центров социальных коммуникаций

Сайт работает в тестовом режиме!
Прежняя версия сайта - old.kantiana.ru.
Направить предложения по улучшению

  • Вернуться к разделам
  • Научная группа «Молекулярная биофизика и био-нано-технологии»

    Научный интерес: биофизика одиночных молекул, исследование механизмов олигомеризации и переключения функциональной активности белковых молекул, исследование структуры и состояния атомов металлов в составе неорганического ядра ферритинов, в том числе с использование установок уровня «Mega-science». 

    Деятельность: Исследования структурно-функциональных характеристик белка Dps Escherichia coli в условиях различного микроокружения и комплексообразования с нуклеиновыми кислотами. Молекулярное моделирование. Оценка термодинамических характеристик нуклеопротеидных комплексов. Полногеномный поиск сайтов связывания белка Dps в бактериальной хромосоме E.coli.

    Цели

    выявление механизмов переключения функциональной активности белка Dps на различных стадиях олигомеризации, областей его клеточной локализации и факторов, влияющих на данный процесс

    поиск лигандов различной природы, оказывающих воздействие на процесс олигомеризации белка

    прикладные исследования структуры и состава неорганического ядра Dps, этапов его формирования и поиск механизмов управления данным процессом для решения создания молекулярных реакторов на базе белка Dps


    Команда


    Научно-исследовательские проекты группы

    1. Изучение взаимосвязи физико-химических процессов, лежащих в основе реализации ДНК-связывающей, ферроксидазной и антиоксидантной активности белка Dps и факторов влияющих на них;

    2. Фундаментальные исследования атомного и электронного строения гибридного наноматериала бактериоферритина Dps и структур на его основе.

    3. Разработка принципов сборки трехмерных олигонуклеотидных конструкций с регулярным распределением ферригидритных ядер бактериоферритина Dps

    4. Структурные и томографические исследования характеристик белка Dps, его неорганического ядра, комплексов Dps с нуклеиновыми кислотами различного состава и структуры, особенностей его клеточной локализации в зависимости от влияния физико-химических факторов и компонентов микроокружения


    Публикации

    1.     Preobrazhenskaya E., Kazantseva O., Kapitunova A., Ozoline O., Antipov S. Identification of Dps protein in culturing medium of Escherichia coli / FEBS Open Bio. – 2019. – Vol. 9. S1.P.421

    2.     Veronika A., Chupakhin E., Mackova L., Antipov S. Comparative evaluation of collagens isolated from hydrobionts and mammals / FEBS Open Bio. – 2019. – Vol. 9. S1.P.418

    3.     S.S. Antipov, E.B. Pichkur, N.V. Praslova, E.V. Preobrazhenskaya, D.S. Usoltseva, E.A. Belikov, O.A. Chuvenkova, M.Yu. Presnyakov, V.G. Artyukhov, O.N. Ozoline, S.Yu. Turishchev High resolution cryogenic transmission electron microscopy study of Escherichia coli Dps protein: first direct observation in quasinative state / Results in Physics. - 2018. - Vol. 11. - P. 926-928. (DOI: https://doi.org/10.1016/j.rinp.2018.10.059). IF 2.147 WoS, Scopus, Q2

    4.     Antipov S., Turishchev S., Purtov Yu., Shvyreva U., Sinelnikov A, Semov Yu., Preobrazhenskaya E., Berezhnoy A., Shusharina A., Novolokina N., Vakhtel V., Artyukhov V., Ozoline O. The Oligomeric Form of the Escherichia coli Dps Protein Depends on the Availability of Iron Ions / Molecules – 2017 -  22(11), 1904. (doi:10.3390/molecules22111904) Scopus, Web of science Q1;

    5.      S.Yu. Turishchev, S.S. Antipov, N.V. Novolokina, O.A. Chuvenkova, A.A. Sinelnikov, E.V. Preobrazhenskaya, R. Ovsyannikov, A.V. Tarasov, D.A. Koyuda, O.N. Ozoline, E.P. Domashevskaya Synchrotron study of Escherichia coli ferritin Dps inorganic core / FEBS Journal – 2017 - Vol. 284. S1. P.203  (Web of science, Q1);

    6.      Antipov S.S., Shvireva U.S., Preobrazhenskaia E.V., Semov Yu. G., Vakhtel V.M. Ozoline O.N. Characterization of iron ions associated with the E. coli Dps protein and their influence on the protein oligomeric form / FEBS Journal – 2017 - Vol. 284. S1. P. 202. (Web of science, Q1);

    7.      Antipov S.S., Tutukina M.N., Preobrazhenskaya E.V., Kondrashov F.A., Patrushev M.V., Toschakov S.V., Dominova I., Shvyreva U.S., Vrublevskaya V.V., Morenkov O.S., Sukharicheva N.A., Panyukov V.V., Ozoline O.N. The Nucleoid Protein Dps Binds Genomic DNA of 1 Escherichia coli in a Non random Manner / Plos One – 2017 – 12(8): e0182800. (https://doi.org/10.1371/journal.pone.0182800) Scopus, Web of science Q1;

    8.     Бессонова Т.А., Шумейко С.А., Пуртов Ю.А., Антипов С.С., Преображенская Е.В., Тутукина М.Н., Озолинь О.Н. Гексуронаты влияют на олигомерную форму структурного белка бактериального нуклеоида Dps и его способность к взаимодействию с линейными фрагментами ДНК / Биофизика – 2016 – 61(6), с. 1059-1067 (Scopus, РИНЦ, Q4);

    9.      Туpищев C.Ю., Антипов C.C., Новолокина Н.В., Чувенкова О.А., Мелеxов В.В., Овcянников P., Cеньковcкий Б.В., Тимченко А.А., Озолинь О.Н., Домашевcкая Э.П. Синxpотpонные иccледования в мягком pентгеновcком диапазоне заpядового cоcтояния ионов железа в феppигидpитном ядpе феppитина Dps Escherichia coli / Биофизика – 2016 – 61(5), с. 837–843 (Scopus, РИНЦ, Q4);

    10. Melekhov V.V., Shvireva U.S., Timchenko A.A., Preobrazhenskaya E.V., Artiukhov V.G., Ozoline O.N., Antipov S.S. Modes of bacterioferritin Dps interaction with DNA as revealed by atomic force microscopy / Plos One – 2015 – DOI: 10.1371/journal.pone.0126504 (Scopus, Web of science, Q1);

    11. Успенская М.Е., Антипова Л.В., Чубирко М.И., Антипов С.С., Гребенщиков А.В. Показатели крови при убое сельскохозяйственных птиц в условиях действующих предприятий / Гигиена и санитария. 2015. Т. 94. № 9. С. 47-50 (РИНЦ, Scopus, Q4)

    12.  Purtov Y.A., Glazunova O. A., Antipov S.S., Pokusaeva V.O., Fesenko E.E.,  Preobrazhenskaya E.V., Shavkunov K.S., Tutukina M.N., Lukyanov V.I., Ozoline O.N. Promoter islands as a platform for interaction with nucleoid proteins and transcription factors /  Journal of Bioinformatics and Computational Biology –  2014 – 12(2):1441006. doi: 10.1142/S0219720014410066. Epub 2014 Mar 6 (Scopus, Web of science, Q3);

    13. Антипов С.С., Покусаева В.О., Мелехов В.В., Артюхов В.Г., Озолинь О.Н. Зависимость эффективности образования нуклеопротеидных комплексов с белком Dps от физико-химических свойств ДНК / Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии, 2013 – Т.7, с. 24 -28 (РИНЦ);

    14.  Покусаева В.О., Антипов С.С., Швырева У.С., Тутукина М.Н., Озолинь О.Н. Суперпродукция, выделение и очистка функционально активного бактериоферритина Dps E.coli / Сорбционные и хроматографические процессы – 2012 – Т.12(6), с. 922-930 (РИНЦ);

    15.  Антипов С.С., Курганов К.В., Чемерис Н.К., Озолинь О.Н. Бактериоферритин как биосенсор и наноструктура / Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А. Овчинникова. - 2007 – Т.3, с. 40-44 (РИНЦ);

    16. Antipov S.S., Ozoline O.N., Fesenko E.E. Low-intensity microwave irradiation of Escherichia coli cells affects the spectrum of synthesized proteins. / Biophysics – 2005 – p. 30-35 (Scopus, РИНЦ, Q4);

     

    Монографии

    1.     Antipova L.V., Storublevtsev S.A., Titov S.A., Antipov S.S., Khatkhokhu M.G., Bolokov M.S., Loboda V.V. A Study of the Use of Modified Collagen of Freshwater Fish as a Material for Personal Care Products / Chapter in Edited Volume Wound Healing, Edited by Dr.Muhammad Ahmad. 2019. - DOI: 10.5772/intechopen.88363

    2.     Антипов С.С., Покусаева В.О. «Исследования структурно-функциональных свойств бактериоферритина Dps E.coli»  / Издательство LAP Lambert Academic Publishing, - 2016 ISBN 978-3-659-82700-6, 72 С, монография;

    Антипов С.С., Озолинь О.Н. «Влияние ЭМИ СВЧ на регуляторные системы E.coli» / Издательство LAP Lambert Academic Publishing - 2013  ISBN 978-3-659-46997-8, 149 С, монография;