У нас новая версия сайта. Сейчас сайт работает в тестовом режиме, ведутся технические работы.
На прежнюю версию сайта вы можете перейти по ссылке - old.kantiana.ru. Ваши правки и предложения мы рады будем получить через Интернет-приемную Центров социальных коммуникаций

Сайт работает в тестовом режиме!
Прежняя версия сайта - old.kantiana.ru.
Направить предложения по улучшению

  • Вернуться к разделам
  • Лаборатория микробиологии и биотехнологиий

    Лаборатория микробиологии и биотехнологий – это объединение профессиональных специалистов в области микробиологии и биотехнологии.

    Основной целью работы лаборатории является проведение фундаментальных и прикладных исследований в фокусе приоритетных направлений развития науки, технологий и техники в Российской Федерации: науки о жизни и рациональное природопользование.

    Основные направления деятельности лаборатории

    1. разработка научно-методических подходов к получению биологически активных веществ для пищевой и фармацевтической промышленности из сырья растительного и животного происхождения

    2. разработка стратегий глубокой биокаталитической переработки органических отходов различного и животного происхождения

    3. скрининг и характеристика микроорганизмов, изолированных из природных экосистем и обладающих антибактериальными и фунгицидными свойствами, в связи с созданием новых антимикробных препаратов

    4. исследование биоразнообразия и функционирования экстремофильных микробных сообществ природных экосистем

    5. поиск и конструирование новых перспективных штаммов-продуцентов промышленно значимых ферментов

    6. разработка научно-методических основ использования экстремофильных микроорганизмов, выделенных из природных источников, в экологической биотехнологии (рекультивация техногенно нарушенных земель)

    7. поиск новых антимикробных агентов микробиологической природы с улучшенными физико-химическими свойствами и широким спектром бактерицидного и фунгицидного, действия, перспективных для использования в качестве биологических консервантов в пищевой промышленности

    8. изучение фундаментальных основ культивирования in vitro изолированных клеток и органов лекарственных растений – продуцентов биологически активных веществ с цитотоксическими, антиоксидантными и антимикробными свойствами

    9. анализ взаимосвязи микробиоты желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) человека со статусом иммунной системы с целью разработки комплексного подхода к ранней диагностике злокачественных новообразований ЖКТ


    Команда


    Научно-исследовательские проекты группы

    • семеноводство продовольственных сортов картофеля отечественных сортов, районированных к условиям выращивания на территории Калининградской области;
    • скрининг и характеристика антагонистических свойств микроорганизмов – экстремофилов, выделенных из Балтийского моря в связи с созданием новых антимикробных препаратов;
    • изучение процессов анаэробной биоремедиации высокомолекулярных полиароматических углеводородов в бескислородных морских осадках Средиземного и Балтийского морей;
    • культивирование изолированных клеток и органов редких растений и эндемичных лекарственных растений Балтики в условиях in vitro как биотехнологический способ получения биологически активных веществ;   
    • поиск новых гидролитических ферментом галофильных микробных сообществ соляных озер о. Моция, Италия.   

    Основные публикации

    1.      Bacterial DNA damage effectors in host cells / V.G. Druzhinin, E.D. Baranova, V.Y. Buslaev, et al. // Ecological Genetics. – 2018. – Vol. 16 (3). – P. 26-36. (Scopus)

    2.      Draft genome sequence of Roseomonas aestuarii strain JR1/69-1-13 isolated from nitrate- and radionuclide-contaminated groundwater in Russia / D.S. Grouzdev, T.L. Babich, T.P. Tourova, et al. // Genome Announcements. – 2018. – Vol. 6. – № 25. – Article number: e00583-18. (Scopus)

    3.      Druzhinin, V.G. Induction and modulation of genotoxicity by the bacteriome in mammals / V.G. Druzhinin, L.V. Matskova, A. Fucic // Mutation Research - Reviews in Mutation Research. – 2018. – Vol. 776. – P. 70-77. (Scopus, Web of science)

    4.      Functional properties of the enzyme-modified protein from oat bran / A. Prosekov, O. Babich, O. Kriger, S. Ivanova, V. Pavsky, S. Sukhikh, Y. Yang, E. Kashirskih // Food Bioscience. – 2018. – V.24. – P. 46-49. 49 (Scopus, Web of science)

    5.      Members of the Uncultured Taxon OP1 (“Acetothermia”) Predominate in the Microbial Community of an Alkaline Hot Spring at East-Tuvinian Upland / A.A. Korzhenkov, A.V. Teplyuk, A.V. Lebedinsky, et al. // Microbiology (Russian Federation). – 2018. – Vol. 87. – № 6. – P. 783-795. (Scopus)

    6.      Microbiome responses to an uncontrolled short-term diet intervention in the frame of the citizen science project / N.S. Klimenko, A.V. Tyakht, A.S. Popenko, et al. // Nutrients. – 2018. – Vol. 10. – № 5. – Article number: 576. (Scopus, Web of science)

    7.      Optimization of Parameters of Enzymatic Hydrolysis of Feather-and-Down Raw Material in a Pilot Installation / A. Prosekov, L. Dishlyuk, S. Sukhih, S. Noskova // Journal of Pharmaceutical Sciences and Research. – 2018. – V. 10(6). – P. 1449-1452. (Scopus)

    8.      Physicochemical properties and indices of chemical and microbiological safety of enzyme hydrolysates from feather-and-down raw material / O. Babich, S. Sukhih, A. Prosekov, A. Lukin // Journal of Pharmaceutical Sciences and Research. – 2018. – V.10 (6). – P. 1530-1533. (Scopus)

    9.      Selection of modes of poultry waste conversion into biofertilizers / O. Babich, S. Sukhih, A. Prosekov, E. Ulrikh, A. Lukin // Journal of Pharmaceutical Sciences and Research. – 2018. – V. 10(7). – P. 1768-1771. (Scopus)

    10. Analysis of chitinase diversity in the Baltic Sea bottom sediments / A.V. Teplyuk, N.I. Samarov, A.A. Korzhenkov, et al. // Microbiology (Russian Federation). – 2017. – Vol. 86. – № 1. – P. 150-154. (Scopus, Web of science)

    11. Antioxidant and antimicrobial activity of bacteriocin-producing strains of lactic acid bacteria isolated from the human gastrointestinal tract        Prosekov, A.Y., Dyshlyuk, L.S., Milentyeva, I.S., Shishin, M.V., Matskova, L.V. // Progress in Nutrition. – 2017. – 19(1), Р. 67-80 (Scopus, Web of science)

    12. Degradation of cofilin is regulated by Cbl, AIP4 and Syk resulting in increased migration of LMP2A positive nasopharyngeal carcinoma cells / M.R. Gainullin, I.Y. Zhukov, X. Zhou, et al. // Scientific Reports. – 2017. – Vol. 7 (1). – Article number 9012. (Scopus, Web of science)

    13. Epstein-Barr virus-encoded LMP2A stimulates migration of nasopharyngeal carcinoma cells via the EGFR/Ca2+/calpain/ITGβ4 axis / Liang, J., Zheng, S., Xiao, X., Huang, G., Zhou, X. 2017 // Biology Open 6(6). Р. 914-922 (Scopus, Web of science)

    14. Formation and study of symbiotic consortium of lactobacilli to receive a direct application starter / S.A. Sukhikh, V.Y. Krumlikov, A.O. Evsukova, L.K. Asyakina // Foods and Raw Materials. – 2017. – V.5(1). – P. 51-62. (Scopus, Web of science)

    15. Modernization of the experimental technological line for the production of enzyme hydrolysates of down and feather raw material / Dyshlyuk L.S., Zubareva E.N., Garmashov S.Y., Sukhikh S.A., Dolganyuk V.F. // Journal of Industrial Pollution Control. – 2017. – V.33. – I.1. –P. 816-823. (Scopus)

    16. Theoretical and practical basics of obtaining bactericide compositions based on cluster silver / L.S. Dyshlyuk, S.Y. Noskova, Y.Y. Sidorin, O.O. Babich, S.A. Sukhikh // Journal of Pharmaceutical Sciences and Research. – 2017. – V.9(10). – P. 1903-1911. (Scopus)

    17. The properties of bacteriocins obtained under the different conditions / M.I. Zimina, A.F. Gazieva, S.A. Sukhih, L.S. Dishluk // Foods and Raw Materials. – 2017. – V.5(2). – P. 128-136. (Scopus, Web of science)

    18. Studying the features of the protein extraction from oat grains / L.S. Dyshlyuk, A.V. Izgaryshev, S.Y. Garmashov, S.A. Sukhikh, E.V. Kashirskih // Journal of Pharmaceutical Sciences and Research. – 2017. – V.9(8). – P. 1344-1349. (Scopus)

    19. A study of polyfunctional properties of biologically active Peptides / Prosekov A., Babich O., Dyshlyuk L., Noskova S., Suhih S. // Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Sciences. – 2016. – V.7. – I.4. – P. 2391-2400. (Scopus, Web of science)

    20. Adverse side effects of anticancer drugs in treatment of children with acute lymphoblastic leukemia / S.V. Babak, A.A. Korzhenkov, N.I. Samarov, et al. // Voprosy Onkologii. – 2016. – Vol. 62. – № 5. – P. 596-605. (Scopus)

    21. Delivery Cas9 into mitochondria / K.E. Orishchenko, J.K. Sofronova, E.G. Chupakhin, et al. // Genes and Cells. – 2016. – Vol. 11. – № 2. – P. 100-105. (Scopus)

    22. Detection of mutations in mitochondrial DNA by droplet digital PCR / J.K. Sofronova, Y.Y. Ilinsky, K.E. Orishchenko, et al. // Biochemistry-Moscow. – 2016. – Vol. 81. – № 10. – P. 1031-1037. (Scopus, Web of science)

    23. Investigating antibiotic activity of the genus bacillus strains and properties of their bacteriocins in order to develop next-generation pharmaceuticals / M.I. Zimina, S.A. Sukhih, O.O. Babich, S.Y. Noskova, A.A. Abrashina, A.Y. Prosekov // Foods and raw materials. – 2016. – V.4. – I.2. – P. 92-100. (Scopus, Web of science)

    24. Methods of production and purification of biologically active peptides / L. Asyakina, O. Babich, V. Dolganuk, S. Suhih // Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Sciences. – 2016. – V.7(4). – P. 2415-2422. (Scopus, Web of science)

    25. Short Chain Fatty Acids (SCFA) Reprogram gene expression in human malignant epithelial and lymphoid cells Astakhova, L., Ngara, M., Babich, O., Ernberg, I., Matskova, L. // PLoS ONE. – 2016. - 11(7). - e0154102 (Scopus, Web of science)

    26. Study of biocompatibility and antitumor activity of lactic acid bacteria isolated from the human gastrointestinal tract   A.Y. Prosekov, L.S.Dyshlyuk, I.S. Milentieva, M.V. Shishin, L.V. Matskova, // International Journal of Pharmacy and Technology. – 2016. – V. 8(2), P. 13647-13661 (Scopus)

    27. Epigenetic downregulation of the ISG15-conjugating enzyme UbcH8 impairs lipolysis and correlates with poor prognosis in nasopharyngeal carcinoma / X. Zhou, J. Wei, F. Chen, L. Matskova, Z. Zhang // Oncotarget. – 2015. – V. 6(38). – P. 41077-41091. (Scopus, Web of science)

    28. Genome-wide mapping of promoter-anchored interactions with close to single-enhancer resolution / P. Sahlén, I. Abdullayev, D. Ramsköld, J. Lundeberg, R. Sandberg // Genome Biology. – 2015. – V. 16(1). – P. 156. (Scopus, Web of science)

    29. Identification of probiotic strains isolated from human gastrointestinal tract and investigation of their antagonistic, antioxidant and antiproliferative properties /  A. Prosekov, I. Milentyeva, S. Sukhikh, M. Shishin, L. Matskova //          Biology and Medicine. – 2015. – V. 7(5). – P. 149-15 (Scopus)

    30. Proteoglycan expression correlates with the phenotype of malignant and non-malignant EBV-positive B-cell lines / A.Y. Tsidulko, L. Matskova, L.A. Astakhova, I. Ernberg, E.V. Grigorieva // Oncotarget. – 2015. – V. 6(41). – P. 43529-43539. (Scopus, Web of science)

    31. SYK interaction with ITGβ4 suppressed by Epstein-Barr virus LMP2A modulates migration and invasion of nasopharyngeal carcinoma cells/  X. Zhou, L. Matskova, L.-S.Z. Rathje, F. Chen, I. Ernberg // Oncogene. – 2015.- V. 34(34). - P. 4491-4499. (Scopus, Web of science)

    32. The disintegration of capsule shells derived from pharmaceutical gelatin's plant analogs / E. Ulrikh, S. Suhih, L. Dishluk, A. Avstrievskikh // Biology and Medicine. – 2015. – V.7. – I.2. (Scopus)

    33. Optimization of conditions for biodegradation of poultry industry wastes by microbial consortium / A. Prosekov, I. Milenteva, S. Sukhikh, L. Dyshlyuk, O. Babich, P. Mitrokhin, L. Asyakina // Asian Journal of Microbiology, Biotechnology and Environmental Sciences. – 2015. – V.17. – I.3. – P. 515-519. (Scopus)

    34. Identification and studying of the biochemical properties of lactobacillus strains / M.I. Zimina, A.J. Prosekov, O.O. Babich, S.A. Sukhih // Life Science Journal. – 2014. – V.11. – I.11. – P. 338-341. (Scopus)

    35. Sukhikh, S.A. Technology of alcohol oxidase production from yeast Candida boidinii for use in functional foods intended for withdrawal syndrome alleviation / S.A. Sukhikh // Foods and Raw Materials. – 2014. – V.2(2). – P. 53-58. (Scopus)

    36. The LMP2A protein of Epstein-Barr virus regulates phosphorylation of ITSN1 and Shb adaptors by tyrosine kinases / O. Dergai, M. Dergai, I. Skrypkina, et al. // Cellular Signalling. – 2013. – Vol. 25. – № 1. – P. 33-40. (Web of Science, Scopus, Impact factor 4.304)

    37. The proteolytic activity research of the lactic acid microorganisms of different taxonomic groups / A. Prosekov, O. Babich, S. Asukhikh, S. Noskova, L. Dushlyuk // World Applied Sciences Journal. – 2013. – 23 (10). – P. 1284-1290. (Scopus)

    38. Stem cell gene expression in MRPS18-2-immortalized rat embryonic fibroblasts / S.P. Yenamandra, S.D. Darekar, V. Kashuba, et al. // Cell Death & Disease. – 2012. – Vol. 3. – Article number: e357 (Web of Science, Scopus, Impact factor 6.044)

    39. Interactome of adaptor protein intersectin family involved in vesicle formation and traffic / I. Skrypkina, L. Tsyba, O. Nikolaienko, et al. // Febs Journal. – 2011. – Vol. 278. – Special Issue: SI Supplement: 1. – P. 130-131. (Web of Science, Impact factor 4.250)

    40. Latent membrane protein 2A (LMP2A) of Epstein-Barr virus interacts with intersectin 1 and targets it for degradation / O. Dergai, M. Dergai, I. Skrypkina, et al. // FEBS Journal. – 2011. – Vol. 278. – Special Issue: SI Supplement: 1. – P. 452-452 (Web of Science, Impact factor 4.250)

    41. The apoptosis modulating role of SAP (SLAM associated protein) contributes to the symptomatology of the X linked lymphoproliferative disease / N. Nagy, L. Matskova, U. Hellman, et al. // Cell Cycle. – 2009. – Vol. 8(19). – P. 3086-3090. (Web of Science, Scopus Impact factor 5.321)

    42. The proapoptotic function of SAP provides a clue to the clinical picture of X-linked lymphoproliferative disease / N. Nagy, L. Matskova, L.L. Kis, et al. // Proc Natl Acad Sci U S A. – 2009. – Vol. 106(29). – P. 11966-11971.  (Scopus, Web of science)

    43. Chemokine CXCL12 enhayces proliferation in pre-B-ALL via STA T5 activation / F. Mowafi, A. Cagigi, L. Matskova, et al. // Pediatric blood and cancer. – 2008. – Vol. 50(4). – P. 812-817. (Scopus, Web of science)

    44. The K15 protein of Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus recrutis the endocytic regulator intersectin 2 through a selective SH3 domain interation / C.S. Lim, B.T. Seet, R.J. Ingham, et al. // Biochemistry. – 2007. – Vol. 46 (35). – Р.9874-9885. (Scopus, Web of science)

    45. The Shb signaling scaffolg binds to and regulates constitutive signals from the Epstein-Barr virus LMP2A membrane protein / L. Matskova, C. Helmstetter, R.J. Ingham, et al. // Oncogene. – 2007. – Vol. 26 (34). – Р. 4908-4917. (Scopus, Web of science)

    46. Ubiquitylation of Cyclin E Requires the Sequential Function of SCF Complexes Containing Distinct hCdc4 Isoforms / F. van Drogen, O. Sangfelt1, A. Malyukova, et al. // Molecular cell. – 2006. – Vol. 23 (1). – P. 37-48. (Scopus, Web of science)

    47. In vitro EBV-infected subline of KMH2, derived from Hodgkin lymphoma, expresses only EBNA-1, while CD40 ligand and IL-4 induce LMP-1 but not EBNA-2 / L.L. Kis, J. Nishikawa, M. Takahara, et al. // International Journal of Cancer. – 2005. – Vol. 113 (6). – P. 937-945. (Scopus, Web of science)

    48. The Epstein-Barr virus protein, latent membrane protein 2A, Co-opts tyrosine kinases used by the T cell receptor / R.J. Ingham, J. Raaijmakers, C.S.H. Lim, G. Winberg, T. Pawson // Journal of Biological Chemistry. – 2005. – V. 280 (40). – P. 34133-34142. (Scopus, Web of science)

    49. WW domains provide a platform for the assembly of multiprotein networks / R.J. Ingham, K. Colwill, C. Howard, et al. // Molecular and cellular biology. – 2005. – Vol. 25 (16). – Р. 7092-7106. (Scopus, Web of science)

    50. Immunization with hepatitis C virus core gene triggers potent T-cell response, but affects CD4+T-cells / M.G. Isaguliants, N.V. Petrakova, E.V. Kashuba, et al. // Vaccine. – 2004. – Vol. 22 (13-14). – P. 1656-1665. (Scopus, Web of science)

    51. C-terminal domain of the Epstein-Barr virus LMP2A membrane ptotein contains a clustering signal / L. Matskova, I. Engermar, T. Pawson, et al. // Journal of virology. – 2001. – V. 75(22). – P. 10941-10949. (Scopus, Web of science)

    52. Latent membrane protein 2A of Epstein-Barr virus binds WW domain E3 protein-ubiquitin ligases that ubiquitinate В-cell tyrosine kinases / G. Winberg, L. Matskova, F. Chen, et al. // Molecular and cellular biology. – 2000. – V. 20 (22). – Р. 8526-8535. (Scopus, Web of science)

    53. A new picornavirus isolated from bank voles (Clethrionomys glareolus) / B. Niklasson, L. Kinnunen, B. Hörnfeldt, et al. // Virology. – 1999. – V. 255 (1). – P. 86-93. (Scopus, Web of science)

    54. Use of collase for cell culturing / L.S. Sandakhchiyev, V.V. Zinovyev, A.A. Tsareva, et al. // Vorosy Virusologll. – 1994. – V. 39 (6). – P. 284-286. (Scopus, Web of science)

    55. Identification of the immunodominant protein-p35 gene of vaccinia virus / V.V. Zinovev, L. Ovechkina, L.V. Matskova, et al. // Molecular Biology. – 1992. – V. 26 (1). – P. 115-121. (Scopus, Web of science)